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完美解决TensorFlow和Keras大数据量内存溢出的问题

运维开发网 https://www.qedev.com 2020-07-05 18:31 出处:网络 作者: 刘开心_8a6c
内存溢出问题是参加kaggle比赛或者做大数据量实验的第一个拦路虎。 以前做的练手小项目导致新手产生一个惯性思维——读取训练集图片的时候把所有图读到内存中,然后分批训练。

内存溢出问题是参加kaggle比赛或者做大数据量实验的第一个拦路虎。

以前做的练手小项目导致新手产生一个惯性思维——读取训练集图片的时候把所有图读到内存中,然后分批训练。

其实这是有问题的,很容易导致OOM。现在内存一般16G,而训练集图片通常是上万张,而且RGB图,还很大,VGG16的图片一般是224x224x3,上万张图片,16G内存根本不够用。这时候又会想起——设置batch,但是那个batch的输入参数却又是图片,它只是把传进去的图片分批送到显卡,而我OOM的地方恰是那个“传进去”的图片,怎么办?

解决思路其实说来也简单,打破思维定式就好了,不是把所有图片读到内存中,而是只把所有图片的路径一次性读到内存中。

大致的解决思路为:

将上万张图片的路径一次性读到内存中,自己实现一个分批读取函数,在该函数中根据自己的内存情况设置读取图片,只把这一批图片读入内存中,然后交给模型,模型再对这一批图片进行分批训练,因为内存一般大于等于显存,所以内存的批次大小和显存的批次大小通常不相同。

下面代码分别介绍Tensorflow和Keras分批将数据读到内存中的关键函数。Tensorflow对初学者不太友好,所以我个人现阶段更习惯用它的高层API Keras来做相关项目,下面的TF实现是之前不会用Keras分批读时候参考的一些列资料,在模型训练上仍使用Keras,只有分批读取用了TF的API。

Tensorlow

在input.py里写get_batch函数。

def get_batch(X_train, y_train, img_w, img_h, color_type, batch_size, capacity):
  '''
  Args:
    X_train: train img path list
    y_train: train labels list
    img_w: image width
    img_h: image height
    batch_size: batch size
    capacity: the maximum elements in queue
  Returns:
    X_train_batch: 4D tensor [batch_size, width, height, chanel],\
            dtype=tf.float32
    y_train_batch: 1D tensor [batch_size], dtype=int32
  '''
  X_train = tf.cast(X_train, tf.string)

  y_train = tf.cast(y_train, tf.int32)
  
  # make an input queue
  input_queue = tf.train.slice_input_producer([X_train, y_train])

  y_train = input_queue[1]
  X_train_contents = tf.read_file(input_queue[0])
  X_train = tf.image.decode_jpeg(X_train_contents, channels=color_type)

  X_train = tf.image.resize_images(X_train, [img_h, img_w], 
                   tf.image.ResizeMethod.NEAREST_NEIGHBOR)

  X_train_batch, y_train_batch = tf.train.batch([X_train, y_train],
                         batch_size=batch_size,
                         num_threads=64,
                         capacity=capacity)
  y_train_batch = tf.one_hot(y_train_batch, 10)

  return X_train_batch, y_train_batch

在train.py文件中训练(下面不是纯TF代码,model.fit是Keras的拟合,用纯TF的替换就好了)。

X_train_batch, y_train_batch = inp.get_batch(X_train, y_train, 
                       img_w, img_h, color_type, 
                       train_batch_size, capacity)
X_valid_batch, y_valid_batch = inp.get_batch(X_valid, y_valid, 
                       img_w, img_h, color_type, 
                       valid_batch_size, capacity)
with tf.Session() as sess:

  coord = tf.train.Coordinator()
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord)
  try:
    for step in np.arange(max_step):
      if coord.should_stop() :
        break
      X_train, y_train = sess.run([X_train_batch, 
                       y_train_batch])
      X_valid, y_valid = sess.run([X_valid_batch,
                       y_valid_batch])
       
      ckpt_path = 'log/weights-{val_loss:.4f}.hdf5'
      ckpt = tf.keras.callbacks.ModelCheckpoint(ckpt_path, 
                           monitor='val_loss', 
                           verbose=1, 
                           save_best_only=True, 
                           mode='min')
      model.fit(X_train, y_train, batch_size=64, 
             epochs=50, verbose=1,
             validation_data=(X_valid, y_valid),
             callbacks=[ckpt])
      
      del X_train, y_train, X_valid, y_valid

  except tf.errors.OutOfRangeError:
    print('done!')
  finally:
    coord.request_stop()
  coord.join(threads)
  sess.close()

Keras

keras文档中对fit、predict、evaluate这些函数都有一个generator,这个generator就是解决分批问题的。

关键函数:fit_generator

# 读取图片函数
def get_im_cv2(paths, img_rows, img_cols, color_type=1, normalize=True):
  '''
  参数:
    paths:要读取的图片路径列表
    img_rows:图片行
    img_cols:图片列
    color_type:图片颜色通道
  返回: 
    imgs: 图片数组
  '''
  # Load as grayscale
  imgs = []
  for path in paths:
    if color_type == 1:
      img = cv2.imread(path, 0)
    elif color_type == 3:
      img = cv2.imread(path)
    # Reduce size
    resized = cv2.resize(img, (img_cols, img_rows))
    if normalize:
      resized = resized.astype('float32')
      resized /= 127.5
      resized -= 1. 
    
    imgs.append(resized)
    
  return np.array(imgs).reshape(len(paths), img_rows, img_cols, color_type)

获取批次函数,其实就是一个generator

def get_train_batch(X_train, y_train, batch_size, img_w, img_h, color_type, is_argumentation):
  '''
  参数:
    X_train:所有图片路径列表
    y_train: 所有图片对应的标签列表
    batch_size:批次
    img_w:图片宽
    img_h:图片高
    color_type:图片类型
    is_argumentation:是否需要数据增强
  返回: 
    一个generator,x: 获取的批次图片 y: 获取的图片对应的标签
  '''
  while 1:
    for i in range(0, len(X_train), batch_size):
      x = get_im_cv2(X_train[i:i+batch_size], img_w, img_h, color_type)
      y = y_train[i:i+batch_size]
      if is_argumentation:
        # 数据增强
        x, y = img_augmentation(x, y)
      # 最重要的就是这个yield,它代表返回,返回以后循环还是会继续,然后再返回。就比如有一个机器一直在作累加运算,但是会把每次累加中间结果告诉你一样,直到把所有数加完
      yield({'input': x}, {'output': y})

训练函数

result = model.fit_generator(generator=get_train_batch(X_train, y_train, train_batch_size, img_w, img_h, color_type, True), 
     steps_per_epoch=1351, 
     epochs=50, verbose=1,
     validation_data=get_train_batch(X_valid, y_valid, valid_batch_size,img_w, img_h, color_type, False),
     validation_steps=52,
     callbacks=[ckpt, early_stop],
     max_queue_size=capacity,
     workers=1)

就是这么简单。但是当初从0到1的过程很难熬,每天都没有进展,没有头绪,急躁占据了思维的大部,熬过了这个阶段,就会一切顺利,不是运气,而是踩过的从0到1的每个脚印累积的灵感的爆发,从0到1的脚印越多,后面的路越顺利。

以上这篇完美解决TensorFlow和Keras大数据量内存溢出的问题就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持我们。

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